Κεντρικός στρατηγικός στόχος του Ινστιτούτου είναι η παροχή ολοκληρωμένης πληροφόρησης σε τοπικό και Εθνικό επίπεδο, η οποία σχετίζεται με δείκτες αποτύπωσης των φυσικών καταστροφών προς τις αρμόδιες για λήψη αποφάσεων δομές πολιτικής προστασίας και την πολιτεία.
Σημαντικός παράγοντας στο αντικείμενο του Ινστιτούτου είναι η ολιστική αντιμετώπιση του ζητήματος των Φυσικών Κινδύνων, ιδιαίτερα με την ανάπτυξη Νέων Τεχνολογιών, Διεργασιών, Υλικών, Εφαρμογών καθώς και την ανάπτυξη Υλικού και Λογισμικού καταγραφικών συστημάτων. Απαραίτητη προϋπόθεση για την επίτευξη αυτής της ολιστικής αντιμετώπισης, είναι η διεπιστημονικότητα σε συναφή επιστημονικά πεδία, που υφίσταται ήδη, στο Ιόνιο Πανεπιστήμιο.
Στρατηγικούς στόχους (ΣΣ) του Ινστιτούτου αποτελούν:
ΣΣ1. Η ανάπτυξη έρευνας σχετικά με τα γενικά αντικείμενα της Μηχανικής των Στερεών και των Ρευστών, της Μετεωρολογίας-Ωκεανογραφίας και της Κλιματικής Αλλαγής
ΣΣ2. Η ανάπτυξη Ενόργανων Υποδομών Παρατήρησης με καινοτόμο υλικό και λογισμικό για τη βελτίωση των διαδικασιών εκτίμησης επικινδυνότητας – τρωτότητας φυσικού, δομημένου και πολιτιστικού περιβάλλοντος από όλων των ειδών τις φυσικές και τεχνολογικές καταστροφές και διασύνδεση αυτών με τις αντίστοιχες και συναφείς Εθνικές υποδομές
ΣΣ3. Η ανάπτυξη έρευνας σε θέματα διαχείρισης κρίσεων και επιπτώσεων Φυσικών Κινδύνων μέσω καινοτόμων λογισμικών λήψης απόφασης
ΣΣ4. Η ανάπτυξη έρευνας σε ζητήματα Παραδοσιακών και Νέων Τεχνικών Πρόληψης και Προστασίας Περιβάλλοντος, Δομικών και Ιστορικών-Μνημειακών Κατασκευών – Αντισεισμικής Προστασίας
ΣΣ5. Η ανάπτυξη έρευνας σε ζητήματα Τεχνολογικών – Βιομηχανικών και Τεχνολογικών Φυσικής Πρόκλησης (NaTech) Κινδύνων, Ρύπανσης και Λυμάτων
ΣΣ6. Η ανάπτυξη έρευνας σε ζητήματα Ανάπτυξης Παραδοσιακών, Προηγμένων και Νέων Υλικών σε Εφαρμογές Προστασίας από Φυσικές Καταστροφές
ΣΣ7. Η ανάπτυξη έρευνας σε ζητήματα όπως η υιοθέτηση ηλεκτροπαραγωγικών μεθόδων με χαμηλό αποτύπωμα άνθρακα, η στροφή στις ανανεώσιμες πηγές ενέργειας και η αποθήκευση της ενέργειας με εφαρμογές, όπως π.χ. σε ενεργειακά αποδοτικές μεταφορές και μεγιστοποίηση της ενεργειακής αποδοτικότητας του κτηριακού αποθέματος
ΣΣ8. Η ανάπτυξη εκπαιδευτικών διαδικασιών και εργαλείων καθώς και η εφαρμογή τους στην επιτόπου (in-situ) εκπαίδευση εμπλεκόμενων κοινωνικών και επαγγελματικών ομάδων στην πρόληψη και αντιμετώπιση Φυσικών Κινδύνων
ΣΣ9. Η κατάστρωση, επικαιροποίηση και παρακολούθηση εφαρμογής σχεδίων προστασίας και ασφάλειας Δημοσίων και Ιδιωτικών φορέων. Ως παράδειγμα αναφέρεται η επικαιροποίηση και παρακολούθηση εφαρμογής του σχετικού σχεδίου που αφορά το Ιόνιο Πανεπιστήμιο
ΣΣ10. Μεσοπρόθεσμος στόχος του Ινστιτούτου είναι η δημιουργία ενός ερευνητικού επιχειρησιακού κέντρου αντιμετώπισης κρίσεων σε συνεργασία με την Περιφέρεια Ιονίων Νήσων